Летом 1619 года посланные из Тобольска казаки «...пошли за волок в тынгусы и Тынгуской острог... ставили». Это был первый русский городок на Енисее, который вскоре стали называть Енисейским острогом.

Очень быстро Енисейск стал торговым и административным центром огромного края. Отсюда на восток, «встречь солнцу», уходили отряды землепроходцев, которые основали Красноярск, Якутск, Иркутск, Нерчинск.

Енисейск стал и духовным центром края. В середине XVII века, в 1642 году на высоком зеленом холме в полукилометре от города, основан был Спасо-Преображенский монастырь.

Рассказывают, что сначала, еще в 1592 году в этих местах поселился пустынножитель, монах Тимофей Иванов, вокруг которого очень быстро собралась небольшая монашеская община выросшая в монастырь, и по большому счету в 1642 году Тобольский архиепископ Герасим по факту его утвердил.

Енисейский монастырь долгое время был небогат. Все его постройки более века оставались деревянными, но в 1730-х годах началось уже каменное строительство.

Первым на месте сгоревшего деревянного построили в камне величественный Спасский собор в традициях сибирского барокко. Освятили его в 1750-х годах. Позднее к нему пристроили Ильинский придел, теплую Покровскую церковь и колокольню.

В 1780-1800 годах в монастыре возвели каменные Святые ворота с надвратной церковью Захария и Елизаветы, часть каменной ограды и настоятельский корпус.

Позже, в 1860 году в церкви на средства енисейского купца А. С. Баландина установили новые иконостасы.

Надо сказать, что Спасо-Преображенский монастырь естественным образом в важный миссионерский и просветительский центр. С 1780 года при нем существовало духовное «училище для всех сословий», перенесенное позже в Красноярск, а потом и церковно-приходская школа.

В одной из келий Спасо-Преображенского монастыря, а затем в местной больнице три года провел ссыльный декабрист Бобрищев-Пушкин.

Монастырь очень сильно пострадал уже после революции. Часть зданий была разрушена.
Но в 1990 году началось возрождение монастыря, которое, собственно, успешно продолжается и по сей день.