Во время гонений на христиан, шедших в четвертом веке, одна благочестивая вдова Иулиания скрылась от преследований с сыном Иоанном и дочерью Фимистией. Время от времени отрок Иоанн тайно посещал богослужения в ближней обители, подвергая опасности себя и семью. Один благочестивый человек посоветовал Иоанну найти для молитв более пустынное место. Тогда он отправился к отшельнику Фармуфию и, получив от него благословение, удалился в пустыню. Юноша нашел пустой глубокий колодец, и, помолившись, бросился вниз. Случилось чудо - Иоанна поддержал ангел, и он остался невредим. Так он и жил на дне колодца, молясь и постясь, более тридцати лет. Однажды к праведнику пришел инок Хрисихий. После долгих просьб монаха, Иоанн Пустынник рассказал ему о своей жизни. Вскоре отшельник скончался и Хрисихий похоронил его. А у колодца по молитвам людей еще не раз происходили чудеса.